De ideas antimonárquicas, Negrete se adhirió al plan de Casa Mata que promulgaba la restitución del congreso y la abdicación de Iturbide.

Cuando éste salió de México se estableció un gobierno provisional llamado Poder Ejecutivo, el cual estaba formado por el general Negrete, Mariano Michelena y Vicente Guerrero.

El poder ejecutivo gobernó hasta octubre de 1824 cuando se designó a Guadalupe Victoria como primer presidente de México.

En 1827, Negrete formó parte de una conspiración que fue descubierta. Por esta misma razón iba a ser fusilado, pero se le otorgó la opción del destierro, así que marchó a Francia donde permaneció hasta su muerte.

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