Tras el destierro al que fue condenado por estar de acuerdo con el levantamiento de diciembre de 1827, Miguel Barragán fue invitado por el presidente interino Gómez Farías para que tomara el cargo como ministro de Guerra.
Cuando se instauró la dictadura de Santa Anna, Barragán y Quintanar se encargaron de someter a los sublevados en Jalisco.

En enero de 1835 fue nombrado presidente interino. Durante este periodo se encargó de ayudar a viudas y gente humilde. Fue partidario de la instauración del centralismo y colaboró eficientemente con Santa Anna.

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